Monsegur foi apanhado pelo FBI e confrontado com uma longa lista de acusações incluindo pirataria e fraude. As autoridades ameaçaram ainda levar as duas primas com quem Hector crescera e este foi o argumento final para que o hacker iniciasse uma colaboração com o FBI, noticia a Cnet. Entre junho de 2011 e março de 2012, as autoridades vigiaram os movimentos de Sabu, com o seu conhecimento, e conseguiram impedir mais de 300 ataques informáticos. Esta vigilância conduziu também à prisão de vários outros hackers internacionais. Estes piratas acusam Monsegur de lhes ter armado uma cilada e de ser o responsável pela sua prisão.
Com a cooperação que prestou, Hector foi absolvido da maior parte dos crimes de que estava acusado e teve de cumprir apenas sete meses na prisão. Sobre os ataques à Sony, o ex-Sabu denuncia que a empresa «estava em risco há mais de seis anos, pelo que sei», reforçando a ideia de que a estrutura informática da empresa não seria segura.
Nesta fase, Hector Monsegur afirma que não tem computador e faz muito pouco uso da Internet.